中国建研院是全国首批获得博士学位、硕士学位授予权的单位之一，拥有土木工程一级学科博士学位授予点、土木水利专业博士学位授予点和建筑技术科学二级学科硕士学位授予点，并建有土木工程博士后科研流动站。

现有博士生导师54人，硕士生导师100余人。硕士研究生学制为3年，博士研究生学制为4年。自1978年起至2024年，共培养博士114名、硕士339名。

2012年起，中国建研院先后与清华大学、同济大学、哈尔滨工业大学及华中科技大学开展硕博士研究生的联合培养。